Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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