Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms