Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin2aP35436 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin2aP35436 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin2aP35436 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin2aP35436 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin2aP35436 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin2aP35436 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin2aP35436 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin2aP35436 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin2aP35436 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin2aP35436 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin2aP35436 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2aP35436 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2aP35436 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2aP35436 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2aP35436 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2aP35436 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2aP35436 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2aP35436 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2aP35436 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2aP35436 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2aP35436 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2aP35436 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2aP35436 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2aP35436 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2aP35436 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2aP35436 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2aP35436 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2aP35436 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Grin2aP35436 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Grin2aP35436 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Grin2aP35436 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin2aP35436 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms