Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SsbP32067 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SsbP32067 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SsbP32067 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SsbP32067 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SsbP32067 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SsbP32067 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SsbP32067 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SsbP32067 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SsbP32067 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SsbP32067 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SsbP32067 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SsbP32067 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SsbP32067 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SsbP32067 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SsbP32067 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SsbP32067 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SsbP32067 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SsbP32067 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SsbP32067 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SsbP32067 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SsbP32067 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SsbP32067 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SsbP32067 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SsbP32067 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SsbP32067 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SsbP32067 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SsbP32067 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SsbP32067 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SsbP32067 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SsbP32067 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SsbP32067 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SsbP32067 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SsbP32067 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SsbP32067 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SsbP32067 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SsbP32067 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SsbP32067 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SsbP32067 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SsbP32067 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SsbP32067 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SsbP32067 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SsbP32067 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SsbP32067 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SsbP32067 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SsbP32067 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SsbP32067 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SsbP32067 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SsbP32067 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SsbP32067 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SsbP32067 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SsbP32067 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SsbP32067 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SsbP32067 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SsbP32067 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SsbP32067 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SsbP32067 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SsbP32067 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SsbP32067 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SsbP32067 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SsbP32067 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SsbP32067 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SsbP32067 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SsbP32067 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SsbP32067 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SsbP32067 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SsbP32067 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SsbP32067 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SsbP32067 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SsbP32067 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SsbP32067 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SsbP32067 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SsbP32067 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SsbP32067 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SsbP32067 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SsbP32067 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SsbP32067 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SsbP32067 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SsbP32067 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SsbP32067 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SsbP32067 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SsbP32067 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SsbP32067 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SsbP32067 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SsbP32067 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SsbP32067 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SsbP32067 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SsbP32067 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SsbP32067 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SsbP32067 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SsbP32067 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SsbP32067 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SsbP32067 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SsbP32067 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SsbP32067 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SsbP32067 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SsbP32067 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SsbP32067 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SsbP32067 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SsbP32067 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms