Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxc5P32043 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc5P32043 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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