Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa3P28310 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa3P28310 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa3P28310 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa3P28310 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa3P28310 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa3P28310 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms