Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PparaP23204 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PparaP23204 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PparaP23204 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PparaP23204 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PparaP23204 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PparaP23204 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PparaP23204 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PparaP23204 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PparaP23204 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PparaP23204 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PparaP23204 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PparaP23204 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PparaP23204 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PparaP23204 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PparaP23204 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PparaP23204 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PparaP23204 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PparaP23204 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PparaP23204 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PparaP23204 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PparaP23204 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PparaP23204 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PparaP23204 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PparaP23204 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PparaP23204 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PparaP23204 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PparaP23204 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PparaP23204 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PparaP23204 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PparaP23204 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PparaP23204 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PparaP23204 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PparaP23204 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PparaP23204 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PparaP23204 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PparaP23204 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PparaP23204 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PparaP23204 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PparaP23204 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PparaP23204 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PparaP23204 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PparaP23204 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PparaP23204 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PparaP23204 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PparaP23204 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PparaP23204 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PparaP23204 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PparaP23204 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PparaP23204 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PparaP23204 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PparaP23204 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PparaP23204 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PparaP23204 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PparaP23204 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PparaP23204 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PparaP23204 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PparaP23204 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PparaP23204 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PparaP23204 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PparaP23204 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PparaP23204 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PparaP23204 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PparaP23204 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PparaP23204 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PparaP23204 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PparaP23204 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PparaP23204 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PparaP23204 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PparaP23204 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PparaP23204 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PparaP23204 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PparaP23204 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PparaP23204 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PparaP23204 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PparaP23204 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PparaP23204 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PparaP23204 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PparaP23204 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PparaP23204 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PparaP23204 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PparaP23204 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PparaP23204 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PparaP23204 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PparaP23204 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PparaP23204 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PparaP23204 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PparaP23204 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PparaP23204 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PparaP23204 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PparaP23204 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PparaP23204 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PparaP23204 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PparaP23204 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PparaP23204 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PparaP23204 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PparaP23204 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PparaP23204 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PparaP23204 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PparaP23204 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms