Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms