Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms