Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms