Protein–RNA interactions for Protein: P10146

Ccl1, C-C motif chemokine 1, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl1P10146 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl1P10146 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl1P10146 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl1P10146 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl1P10146 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl1P10146 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccl1P10146 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl1P10146 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl1P10146 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl1P10146 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl1P10146 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl1P10146 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl1P10146 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl1P10146 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl1P10146 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl1P10146 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl1P10146 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccl1P10146 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl1P10146 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms