Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Myod1P10085 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Myod1P10085 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Myod1P10085 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Myod1P10085 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Myod1P10085 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms