Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TnfP06804 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TnfP06804 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TnfP06804 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TnfP06804 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TnfP06804 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TnfP06804 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TnfP06804 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TnfP06804 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TnfP06804 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TnfP06804 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TnfP06804 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TnfP06804 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
TnfP06804 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
TnfP06804 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TnfP06804 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TnfP06804 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TnfP06804 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TnfP06804 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TnfP06804 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TnfP06804 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TnfP06804 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TnfP06804 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TnfP06804 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TnfP06804 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TnfP06804 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TnfP06804 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TnfP06804 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TnfP06804 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TnfP06804 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TnfP06804 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TnfP06804 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TnfP06804 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TnfP06804 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TnfP06804 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TnfP06804 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TnfP06804 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TnfP06804 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TnfP06804 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TnfP06804 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TnfP06804 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TnfP06804 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TnfP06804 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TnfP06804 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TnfP06804 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TnfP06804 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TnfP06804 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TnfP06804 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TnfP06804 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TnfP06804 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TnfP06804 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TnfP06804 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TnfP06804 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TnfP06804 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TnfP06804 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TnfP06804 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TnfP06804 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TnfP06804 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TnfP06804 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms