Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CopeO89079 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CopeO89079 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CopeO89079 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CopeO89079 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CopeO89079 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CopeO89079 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CopeO89079 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CopeO89079 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CopeO89079 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CopeO89079 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CopeO89079 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CopeO89079 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CopeO89079 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CopeO89079 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CopeO89079 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CopeO89079 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CopeO89079 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CopeO89079 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CopeO89079 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CopeO89079 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CopeO89079 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CopeO89079 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CopeO89079 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CopeO89079 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CopeO89079 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CopeO89079 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CopeO89079 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CopeO89079 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CopeO89079 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CopeO89079 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CopeO89079 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CopeO89079 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CopeO89079 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CopeO89079 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CopeO89079 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CopeO89079 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CopeO89079 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CopeO89079 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CopeO89079 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CopeO89079 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CopeO89079 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CopeO89079 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CopeO89079 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CopeO89079 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CopeO89079 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CopeO89079 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CopeO89079 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CopeO89079 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CopeO89079 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CopeO89079 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CopeO89079 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CopeO89079 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CopeO89079 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CopeO89079 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CopeO89079 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CopeO89079 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CopeO89079 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CopeO89079 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CopeO89079 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CopeO89079 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CopeO89079 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CopeO89079 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CopeO89079 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CopeO89079 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CopeO89079 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CopeO89079 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CopeO89079 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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CopeO89079 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CopeO89079 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CopeO89079 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CopeO89079 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CopeO89079 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CopeO89079 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CopeO89079 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CopeO89079 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CopeO89079 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CopeO89079 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CopeO89079 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CopeO89079 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CopeO89079 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CopeO89079 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CopeO89079 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CopeO89079 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CopeO89079 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CopeO89079 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CopeO89079 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CopeO89079 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CopeO89079 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CopeO89079 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CopeO89079 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CopeO89079 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CopeO89079 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CopeO89079 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CopeO89079 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CopeO89079 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CopeO89079 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CopeO89079 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CopeO89079 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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