Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms