Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TnxbO35452 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TnxbO35452 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TnxbO35452 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TnxbO35452 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TnxbO35452 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TnxbO35452 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TnxbO35452 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TnxbO35452 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TnxbO35452 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TnxbO35452 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms