Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Polr1aO35134 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms