Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Gm20795J3QP49 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Gm20795J3QP49 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Gm20795J3QP49 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Gm20795J3QP49 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Gm20795J3QP49 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Gm20795J3QP49 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Gm20795J3QP49 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Gm20795J3QP49 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Gm20795J3QP49 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Gm20795J3QP49 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Gm20795J3QP49 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Gm20795J3QP49 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Gm20795J3QP49 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Gm20795J3QP49 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20795J3QP49 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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