Protein–RNA interactions for Protein: J3QN01

Ms4a18, Membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 18, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a18J3QN01 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ms4a18J3QN01 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ms4a18J3QN01 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms