Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms