Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn34c3J3QJW5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms