Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp408H7BX78 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms