Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp72F8VQC1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms