Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gm28038F7BCN9 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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