Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Urb2E9Q7L1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms