Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fndc1E9Q043 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms