Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms