Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Srp54bE9PXC0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms