Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc175E9PVB3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms