Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim12cD3Z3L3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim12cD3Z3L3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms