Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc6D3YZP9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc6D3YZP9 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms