Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap58B2RW38 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms