Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clrn2B2RVW2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms