Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Trabd2bB1ATG9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Trabd2bB1ATG9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Trabd2bB1ATG9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms