Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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Atp8b5A3FIN4 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Atp8b5A3FIN4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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