Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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