Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Frmpd1A2AKB4 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms