Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprfA2A8L5 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms