Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Speer3W4VSP1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms