Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Krt27Q9Z320 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Krt27Q9Z320 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Krt27Q9Z320 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Krt27Q9Z320 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt27Q9Z320 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Krt27Q9Z320 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Krt27Q9Z320 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt27Q9Z320 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt27Q9Z320 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt27Q9Z320 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt27Q9Z320 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Krt27Q9Z320 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Krt27Q9Z320 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt27Q9Z320 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt27Q9Z320 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt27Q9Z320 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt27Q9Z320 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt27Q9Z320 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt27Q9Z320 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt27Q9Z320 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt27Q9Z320 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt27Q9Z320 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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Krt27Q9Z320 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt27Q9Z320 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Krt27Q9Z320 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt27Q9Z320 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Krt27Q9Z320 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms