Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip6Q9Z1Y4 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms