Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkraQ9WTX2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkraQ9WTX2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkraQ9WTX2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkraQ9WTX2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms