Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NrkQ9R0G8 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NrkQ9R0G8 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NrkQ9R0G8 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NrkQ9R0G8 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NrkQ9R0G8 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NrkQ9R0G8 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NrkQ9R0G8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NrkQ9R0G8 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NrkQ9R0G8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NrkQ9R0G8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NrkQ9R0G8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NrkQ9R0G8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NrkQ9R0G8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NrkQ9R0G8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NrkQ9R0G8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NrkQ9R0G8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NrkQ9R0G8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NrkQ9R0G8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms