Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Limd1Q9QXD8 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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Limd1Q9QXD8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Limd1Q9QXD8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Limd1Q9QXD8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Limd1Q9QXD8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Limd1Q9QXD8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Limd1Q9QXD8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Limd1Q9QXD8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Limd1Q9QXD8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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