Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gde1Q9JL56 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gde1Q9JL56 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gde1Q9JL56 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gde1Q9JL56 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gde1Q9JL56 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gde1Q9JL56 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gde1Q9JL56 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gde1Q9JL56 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gde1Q9JL56 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gde1Q9JL56 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gde1Q9JL56 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gde1Q9JL56 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gde1Q9JL56 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gde1Q9JL56 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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