Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra4Q9JJT2 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms