Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Usp29Q9ES63 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Usp29Q9ES63 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Usp29Q9ES63 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Usp29Q9ES63 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Usp29Q9ES63 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Usp29Q9ES63 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Usp29Q9ES63 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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