Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Xab2Q9DCD2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Xab2Q9DCD2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Xab2Q9DCD2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Xab2Q9DCD2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Xab2Q9DCD2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Xab2Q9DCD2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Xab2Q9DCD2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Xab2Q9DCD2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Xab2Q9DCD2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Xab2Q9DCD2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Xab2Q9DCD2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Xab2Q9DCD2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Xab2Q9DCD2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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