Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmg20aQ9DC33 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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