Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SrpraQ9DBG7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SrpraQ9DBG7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SrpraQ9DBG7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SrpraQ9DBG7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SrpraQ9DBG7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrpraQ9DBG7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrpraQ9DBG7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrpraQ9DBG7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrpraQ9DBG7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrpraQ9DBG7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrpraQ9DBG7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrpraQ9DBG7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrpraQ9DBG7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrpraQ9DBG7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrpraQ9DBG7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrpraQ9DBG7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrpraQ9DBG7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrpraQ9DBG7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrpraQ9DBG7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrpraQ9DBG7 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrpraQ9DBG7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrpraQ9DBG7 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrpraQ9DBG7 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SrpraQ9DBG7 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrpraQ9DBG7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrpraQ9DBG7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrpraQ9DBG7 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrpraQ9DBG7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SrpraQ9DBG7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrpraQ9DBG7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrpraQ9DBG7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrpraQ9DBG7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrpraQ9DBG7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrpraQ9DBG7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrpraQ9DBG7 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrpraQ9DBG7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SrpraQ9DBG7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SrpraQ9DBG7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms